Z BIOCEV do Rennes: Barrande stipendium je obrovská příležitost
Doktorské studium je cestou objevování. Ale co když cesta překročí hranice, zavede vás do špičkových laboratoří a hluboko do tajů kontroly kvality buněk? Díky prestižnímu Barrandovu stipendiu má PhD studentka Bailasan Haidar z laboratoře Jiřího Zahradníka (1. lékařská fakulta UK v BIOCEV) jedinečnou příležitost provádět výzkum jak v České republice, tak ve Francii, kde se zaměřuje na roli endoplazmatického retikula v procesu skládání proteinů a vzniku nemocí. Náročná, ale nesmírně obohacující zkušenost. Od překonání výzev v samotné žádosti, až po adaptaci na nové vědecké prostředí.
Bailasan Haidar je studentkou 2. ročníku PhD studia v oboru molekulární a buněčné biologie, genetiky a virologie na Přírodovědecké fakulta Univerzity Karlovy. Zároveň působí v Laboratoři proteinového inženýrství (1. LF UK / BIOCEV), vedené Jiřím Zahradníkem. Přečtěte si, jak Barrandovo stipendium formovalo její vědeckou dráhu a proč si myslí, že mezinárodní spolupráce je klíčem k průlomovému výzkumu.
Jsme rádi, že sis ve svém nabitém harmonogramu našla čas podělit se s námi o své poznatky ze studia, které je výjimečné v mnoha ohledech. Můžeš nám na úvod vysvětlit, proč tomu tak je?
Mám velkou radost, že se s vámi mohu podělit o svůj úspěch a zkušenosti se získání prestižního stipendia Barrande Fellowship v rámci cotutelle programu v roce 2024. Program Barrande Fellowship je společný česko-francouzský stipendijní program na podporu výměnných pobytů českých a francouzských doktorandů. Díky tomuto stipendiu realizuji podstatnou část svého výzkumu ve Francii, spolupracuji s předními odborníky a využívám špičkové výzkumné infrastruktury.
Můžeš nám stručně popsat svůj výzkumný projekt a vysvětlit, proč je důležitý?
Téma mého doktorského výzkumu se zaměřuje na detailní zhodnocení systému kontroly kvality proteinů v endoplazmatickém retikulu (ER) kvasinkových a savčích buňek. Endoplazmatické retikulum je klíčovým regulátorem syntézy a skládání proteinů, které jsou exportovány na povrch a z buněk. Odhalení mechanismů jeho kontrolního systému může přinést zásadní poznatky pro vývoj terapeutických přístupů k neurodegenerativním onemocněním a rakovině, ale také vybraných virových infekcí.
Endoplazmatické retikulum představuje vstupní bod proteinů do sekreční dráhy. Nově syntetizované peptidy zde interagují se systémem kontroly kvality ER, který zajišťuje správné skládání proteinů. Chyby v tomto procesu můhou vést ke ztrátě funkce proteinů a k cytotoxické agregaci nesprávně složených proteinů, což může způsobit smrt buňky. Aby se buňky vyrovnaly se zvýšeným množstvím nesložených proteinů v ER, vyvinuly mechanismus známý jako unfolded protein response (UPR). Přestože máme poměrně detailní popis tohoto systému, chybí nám funkční a kvantitativní údaje, což znamená, že nejsme schopni předpovědět osud mutovaných proteinů v ER.
Naše nedávné výzkumy ukázaly využitelnost proteinového inženýrství pro podrobnou analýzu mechanismů kontroly kvality. Významně se zde uplatňují metody proteinového inženýrství a genové knihovny, které umožňují detailní hodnocení vlastností a přísnosti těchto kontrolních mechanismů. Naším cílem je odhalit skryté aspekty tohoto systému a přinést nové poznatky, které mohou být vysoce relevantní pro biomedicínu.
Čím je jedinečný program meziuniverzitního studia (cotutelle) v rámci Barrande Fellowship?
Program meziuniverzitního studia Barrande Fellowship (cotutelle) představuje výjimečnou příležitost, která nabízí mezinárodní vědecké prostředí a možnost spolupracovat se dvěma prestižními univerzitami a laboratořemi. Pracuji na univerzitě v Rennes ve Francii, kde spolupracuji s týmem specializujícím se na stresovou signalizaci (ER stres) a rakovinu. Toto partnerství mi umožňuje přístup k nejmodernějším metodám, výměnu znalostí a získání širší perspektivy na můj výzkum.
Jaké výzvy jsi musela překonat při získávání Barrande Fellowship?
Proces získání Barrande Fellowship byl sice nesmírně obohacující, ale přinesl také mnoho výzev. Jedním z nejnáročnějších úkolů bylo najít ideální hostitelskou instituci a vybudovat spolupráci s francouzským výzkumným týmem. To vyžadovalo rozsáhlou komunikaci, sladění výzkumných cílů a doladění návrhu projektu tak, aby odpovídal jejich odbornosti.
Dalším zásadním krokem bylo vytvoření přesvědčivého výzkumného návrhu. Musela jsem jasně vysvětlit vědecký význam svého projektu interdisciplinární komisi a zároveň demonstrovat jeho přínos pro bilaterální výzkum. Kromě toho bylo nutné překonat administrativní překážky – sestavit potřebné dokumenty, hlídat termíny a koordinovat proces mezi dvěma akademickými institucemi ve dvou různých zemích. Výzvou bylo také přizpůsobit se novému výzkumnému prostředí, překonat jazykové a kulturní bariéry a budovat novou profesní síť. Rovněž bylo nutné vyvážit spolupráci mezi původní a hostitelskou laboratoří, což přinášelo komplikace v komunikaci, koordinaci výzkumu a sladění očekávání více školitelů.
Jaká je tvoje zkušenost se životem a prací ve Francii?
Kromě akademických a výzkumných přínosů je život ve Francii úžasným zážitkem. Rennes je krásné město v Bretani, plné historie a osobitého kouzla, s bohatou kulturní scénou a mírným oceánským klimatem. Přátelská atmosféra na pracovišti mi usnadnila adaptaci a v laboratoři jsem našla velkou podporu od svých kolegů. Ať už jde o procházky historickými uličkami, ochutnávání místní kuchyně nebo objevování nádherných koutů Bretaně, každý den přináší něco nového.
Jak Barrande Fellowship ovlivnilo tvůj výzkum a osobní rozvoj?
Barrande Fellowship pro mě bylo a stále je transformační zkušeností, která mi poskytla nesmírné příležitosti pro vědeckou spolupráci i osobní růst. Pobyt ve Francii mi umožňuje rozvíjet svůj výzkum, budovat mezinárodní profesní síť a přispívat ke společným vědeckým cílům mezi Českou republikou a Francií.
Doufám, že můj příběh inspiruje další výzkumníky z řad studentů v centru BIOCEV k tomu, aby se nebáli usilovat o podobné mezinárodní meziuniverzitní příležitosti. Přestože tato cesta přináší mnoho výzev, přínosy v oblasti vědecké inovace, rozvoje dovedností a kulturního obohacení za to rozhodně stojí.
Na závěr, jak se mohou ostatní dozvědět více o Barrande Fellowship nebo o tvém výzkumu?
Pokud máte jakékoli dotazy ohledně Barrande Fellowship cotutelle nebo mého výzkumu, neváhejte mě kontaktovat. Ráda se podělím o své zkušenosti a pomohu ostatním v orientaci na cestě k úspěchu.
Děkujeme za rozhovor a přejeme mnoho osobních i vědeckých úspěchů!
Autor: BIOCEV 1. LF UK
Titulní foto: zleva - Radka Vildová (MŠMT), Bailasan Haidar a Stéphane Crouzat, velvyslanec Francie v ČR / autor: René Volfík
Základní informace a pravidla soutěže najdete na webových stránkách Francouzského institutu v Praze: ZDE
